單株銀杏一般較少發生病蟲害。但是，在連片的銀杏園，不僅病蟲害種類繁多，而且也會成災，造成嚴重的損失。常見的銀杏病蟲害主要有以下幾種：
1.銀杏干枯病 
銀杏干枯病，又稱銀杏胴枯病，全國各主要銀杏產區均有分布，常見于生長衰弱的銀杏樹。 
1.1癥狀 
病菌侵入后，在光滑的樹皮上，產生光滑的病斑，圓形或不規則形。以后病斑繼續擴大，患病部位漸見腫大，樹皮出現縱向開裂。春季，在受害樹皮上，可見許多枯黃色的龐狀子囊抱子座，直徑l一3毫米。天氣潮濕時，從子囊抱子座內會擠出一條條淡黃色至黃色卷須狀分生抱子角。秋季，子座變枯紅色到醬紅色，中間逐漸形成子囊殼。病樹皮層和木質部間，可見羽毛狀扇形菌絲體層，初為污白色，后為黃褐色。感病枝干的病斑蔓延，逐步使樹皮成環狀壞死，比較后導致枝條和植株死亡。
1.2病原 
病原為子囊菌綱、球殼菌目真菌。該病菌亦能侵染板栗等林木。
1.3發病規律 
病原菌由傷口侵入，弱寄生性。病菌以菌絲體及分生孢子器在病枝中越冬。待溫度回升，便開始活動。長江流域及長江以南，3月底至4月初開始出現癥狀，并隨氣溫的升高而加速擴展，直到10月下旬停止。分生孢子借助雨水、昆蟲、鳥類傳播，并能多次反復侵染。
1.4防治方法
⑴加強管理，增強樹勢，提高植株抗性。這是防治銀杏干枯病的關鍵措施。
⑵重病株和患病死亡的枝條，應及時清理銷毀，徹底清除病原。
⑶及時刮除病斑，并用1：1：100波爾多液或50%多菌靈可濕性粉劑100倍液或0.1的升汞水、1％硫酸亞鐵溶液、石灰涂白劑涂刷傷口，以殺滅病菌并防止病菌擴散。
2.銀杏早期黃化病
2.1癥狀
起始癥狀是：葉面頂端邊緣開始失綠呈淺黃色，有光亮。以后逐步向葉基擴展，嚴重時半張葉片黃化，顏色逐步轉為褐色，灰色，呈枯死狀。
2.2病原
無病原，是由缺鋅引起的一種生理病害。
2.3發病規律 
一般從6月上旬開始發病， 7月中旬至8月下旬病斑迅速擴大，病葉逐步枯死。
2.4防治方法
3月下旬到4月上旬，對銀杏病株施用鋅肥。幼樹每株施80—100克硫酸鋅，大樹每株施1000—1500克硫酸鋅。 
3.銀杏葉枯病
3.1癥狀
銀杏葉面產生大小不等的枯斑。
3.2發病規律
銀杏苗木一般從6月開始發病，大樹發病稍遲。在8—9月份為發病盛期，10月份后逐漸停止。進入結實期的大樹，雌樹發病較重。發病嚴重程度與栽培管理等有關。
3.3防治方法
⑴加強管理，增強樹勢，提高植株抗性。
⑵在上一年發病區，于第二年發病前，噴施50%多菌靈可濕性粉劑100倍液，可以抑制病菌孢子萌發。
⑶秋、冬季節在銀杏林中，特別是在銀杏幼林中間種蠶豆等，可以促進落葉分解，減少病原存活的數量和產生分生孢子的能力，從而減輕病害發生和危害程度。 
4、銀杏莖腐病
又叫苗枯病，主要受害對象是當年播種苗。2至4年生苗也可能受害。
4.1癥狀
莖基變成褐色，葉片失去正常綠色，稍向下垂，感病部位迅速向上擴展，直至全株死亡。
4.2發病規律
夏季土溫增高，苗木莖基部受灼傷，病菌從傷口侵入。圃地低洼積水，苗木生長不良也易發病。
4.3防治方法
⑴加強田間管理，夏季搭陰棚、插樹枝或在行間蓋草遮陰。
⑵及時清除病苗。撫育時不要碰傷苗木，以免病菌從傷口侵入。
⑶噴1∶1∶200倍波爾多液，每半月一次，連續噴灑2～3次。
5、銀杏大蠶蛾
銀杏大蠶蛾又名白毛蟲，屬鱗翅目、大蠶蛾科。
5.1寄主
主要有銀杏、核桃、漆樹等，以幼蟲取食葉片。由于幼蟲食葉量大，大發生時可將整株銀杏葉片全部吃光。
5.2形態特性
成蟲：雄蛾體深褐色，翅展約125毫米，體長約35毫米，觸角羽毛狀。雌蛾體紅褐色，翅展約135毫米，體長約40毫米，觸角梢齒狀。觸角顏色同體色。前翅外緣略向里凹，近頂角處，有一明顯黑斑；后翅中室有一明顯的眼狀班。前后翅均有一條很明顯的波狀橫線，并與外緣基本平行。
卵：初產卵鮮綠色，后漸變為灰白色，常附有米黃色花紋。橢圓形，兩端略平，頂端有一明顯的小黑點。長徑2.2—2.5毫米，短徑1.2－1.5毫米，排列不整齊。
幼蟲：胸腹部共10節，足8對。初孵幼蟲腹部呈黃色或灰白色，具黑線；頭部與體背黑色；體背有白色毛束。3齡后逐漸變成淺綠色，6—7齡轉為綠色。各齡期體背每節均附有先為黃綠色后變成白色的毛囊兩對，著生于四個瘤上。除尾節外，每節兩側下方有一直立的眼狀藍色橢圓斑。老熟幼蟲體背毛囊連成整齊的毛帶，體長100一120毫米，寬10—15毫米。
繭：初為銀白色，后漸變成褐色。橢圓形，長50—55毫米，寬20—25毫米。繭殼具孔，孔形不規則。繭絲質粗，表面光滑無毛，革質。繭后端具開放孔。
蛹：長38—44毫米，寬13—17毫米。復眼棕色凹陷。附肢及分節清晰，尤其是第5、6、7腹節，具三條棕色帶。腹節兩邊下側各著生一個橢圓形的棕色斑。羽化前，蛹由黃色變為褐色。 
5.3生活史及生活習性 
銀杏大蠶蛾一年一代，以卵越冬。卵期延續到次年5月中旬，中旬起孵化成幼蟲。幼蟲一般7齡，少有8齡。每個齡期約l周，整個幼蟲期約60天。7月中旬起化蛹，蛹期約40天，9月上旬見成蟲。成蟲期約10天。在南方，銀杏大蠶蛾的卵于3月底到4月初開始孵化，但蛹期稍長，—般6月初已見化蛹，一直到8月底、9月初才羽化、交尾、產卵。往北，各期略向后推遲。
銀杏大蠶蛾大多于傍晚羽化。剛羽化時，蛾體周身潮濕，翅緊貼體壁，1—2小時后即能飛翔。一般羽化后4—12小時內交尾。交尾時，雌蛾靜伏不動，雄蛾以尾部與雌蛾相接，雌雄蛾頭部各置相反方向，成一字形靜伏于樹干上，時間長達16—24小時，這時即使有人觸動也不分離。交尾后很快產卵。雌蛾在10天內可產卵3—4次，共有250—400粒。卵集中成塊，或單層排列，多產于背風向陽的老齡樹的樹干離地1—3米的表皮裂縫內或凹陷處。幼蟲孵化不整齊。一般陽坡早于陰坡，前后可以相差半個月之多。孵化后一小時內，多聚集在卵塊附近，以后即上樹取食。3齡前喜群集，4齡后逐漸分散。一般于白天取食。在南方，中午日照強烈時，幼蟲有向下轉移以避高溫的習性。幼蟲食葉量大，一頭6齡幼蟲，4小時內可食銀杏葉250毫克。各齡幼蟲蛻皮的時間不等。蛻皮前，體色增深，食量減退，不愛活動，腹足附有絲狀物粘著于小枝。蛻皮后體毛多，體色鮮艷，頭殼、足和毛瘤呈黃色。經1—2小時頭殼即轉變為黑色，體積可比蛻皮前增長一倍左右。老熟幼蟲可在樹上或樹下結繭。
5.4防治方法 
⑴燈光誘殺：利用成蟲的趨光性，在成蟲羽化盛期（9月上、中旬），用黑光燈誘殺，效果甚好。
⑵摘卵塊：根據其產卵地點選擇性強、卵期長、卵塊集中并易于清除的特點，在銀杏大蠶蛾大發生時，組織人力清除卵塊。
⑶藥劑防治：銀杏大蠶蛾幼蟲3齡前抵抗力弱，并有群集性的特點，及時噴施90％的敵百蟲1500—2000倍液或25％滅幼脲500倍液，殺蟲效果可達100％。也可使用1.2％苦•煙乳油植物殺蟲劑。 
⑷生物防治：銀杏大蠶蛾天敵眾多，如赤眼蜂、柞蠶絨繭蜂等。注意保護天敵，產卵期后人工釋放赤眼蜂等，可以使80％以上的卵塊消滅于孵化之前。
6、樟蠶
屬鱗翅目、大蠶蛾科。
6.1寄主
雜食性害蟲，危害銀杏、樟樹、板栗、楓楊、楓香、樺木、檫木、枇杷、柑桔等。嚴重時可將葉片吃光，影響樹木生長。
6.2形態特性
成蟲：雌蛾體長32-35毫米，翅展約100-115毫米，雄蛾略小。體翅灰褐色，前翅基部暗褐色，外側為一褐條紋，條紋內緣略呈紫紅色；翅中央有一眼狀紋，翅頂角外側有紫紅色紋兩條，內側有黑褐色短紋兩條；外橫線棕色、雙鋸齒形；翅外緣黃褐色，其內側有白色條紋。后翅與前翅略同。
卵：橢圓形，乳白色，初產卵呈淺灰色，長徑2毫米左右。卵塊表面覆有黑褐色絨毛。
幼蟲：初孵幼蟲黑色，成長幼蟲頭黃色，胴部青黃色，被白毛。各節亞背線、氣門上線及氣門下線處，生有瘤狀突起，瘤上具黃白色及黃褐色刺毛。腹足外側有橫列黑紋，臀足外側有明顯的黑色斑塊。臀板有3個黑點，或僅有1個，甚至完全消失。體長74—92毫米。
蛹：紡錘形，黑褐色，體長27­—34毫米。外被棕色厚繭。
6.3生活史及生活習性
1年發生1代，以蛹在枝干、樹皮縫隙等處的繭內越冬。3月上旬開始羽化，4月上中旬為羽化盛期。成蟲羽化后不久即可交尾，有強趨光性。卵產于枝干上，由幾十粒至百余粒組成卵塊，卵粒呈單層整齊排列，上披有黑色絨毛，常不易被察覺。2—4月間幼蟲相繼出現，1—3齡幼蟲群集取食，4齡以后分散為害，5月下旬至6月上中旬幼蟲老熟，陸續結繭化蛹，至7月下旬全部化蛹完畢。
6.4防治方法
⑴燈光誘殺：利用成蟲的強趨光性，在成蟲羽化盛期用殺蟲燈誘殺，或老熟幼蟲下樹時人工捕殺。
⑵在冬季人工刮除卵塊，或6至7月摘除繭蛹。
⑶藥劑防治：對幼蟲噴無公害綠色農藥—25％阿維菌素·滅幼脲3號懸浮劑，使用濃度為1500—2500倍液，一般施藥24小時后開始中毒死亡。使用前務必將瓶下部沉淀搖起，混勻后再使用。本劑對蠶有毒，養蠶區不宜使用。或噴施65％的敵百蟲500—800倍液。也可使用1.2％苦•煙乳油植物殺蟲劑。 
7、茶色金龜子
俗名“硬殼蟲”，南方地區普遍發生。
7.1寄主
雜食性害蟲，危害銀杏、核桃、板栗、油茶、油桐、刺槐、梧桐、楓楊等多種樹木。其成蟲取食葉片與嫩枝，幼蟲(蠐螬)則危害根系。蟲口密度大的地方，可將葉片、嫩梢吃光，嚴重影響銀杏生長結實。
7.2形態特征
成蟲：體長10—11.5毫米，長橢圓形，茶褐色。全身密被灰色絨毛。翅鞘上有4條縱線，并雜生灰白色小毛斑。腹面栗褐色，亦具絨毛。
卵：橢圓形，乳白色。長約1.5毫米，寬約0.4毫米。
幼蟲：俗稱“蠐螬”，又叫“土蠶”，乳白色，頭部黃褐色，口器深褐色。觸動時，全身蜷縮成馬蹄狀。體表多皺紋及體毛。臀片上剛毛不規則散生。老熟幼蟲乳黃色，長約3—6厘米。
蛹：初為乳白色，后轉為淡黃色，羽化前轉變為黃褐色。腹未有一對突起。
7.3生活史及生活習性
茶色金龜子一年一代，以老熟幼蟲在土中越冬。越冬幼蟲于次年4月下旬化蛹并羽化。羽化后即外出危害各種植物的葉片與嫩枝。一般白天潛伏于土中，傍晚前后成群外出取食。6月初開始產卵。卵期約10—15天。幼蟲取食植物根部。越冬前，先筑土室，幼蟲在土室中越冬。成蟲具假死性。 
7.4防治方法
⑴捕捉成蟲：利用成蟲的假死性，在成蟲羽化盛期，于傍晚群集危害時，震落成蟲，搜集并殺之。
⑵殺滅幼蟲：結合中耕除草，破壞越冬土室，并及時殺滅蠐螬。 
 ⑶藥劑防治：成蟲危害盛期，于下午4時起，噴施90％的敵百蟲1000倍液或25％滅幼脲500倍液等殺滅成蟲。
8、白蟻、木蠢蛾
由于銀杏樹皮、根皮與木材內都富含醣分，所以，極易招來白蟻、木蠢蛾的危害。白蟻、既能危害幼苗，也能危害成年樹。受害者，輕則斷枝折梢，重者植株大部死亡。
8.1白蟻防治：
⑴在危害嚴重的林內，在白蟻活動頻繁的4―11月，間隔1―2米將草皮、枯枝落葉和一些泥土堆成小堆，堆中噴2―3克滅蟻靈。
⑵在白蟻活動期，選擇空氣濕度大的陰天，在蟻路和在外活動的白蟻身上施撒白僵菌，使其相互感染。
.2木蠹蛾的防治：
⑴產卵前樹干涂白，防止成蟲產卵。
⑵幼蟲危害初期，挖除皮下群集幼蟲。
⑶在成蟲羽化盛期用殺蟲燈誘殺成蟲。
⑷成蟲產卵期在樹干2米以下噴灑50％對硫磷400―500倍液或25％滅幼脲500倍液，毒殺蟲卵和初孵幼蟲。
⑸幼蟲危害期用80％敵敵畏或40％氧化樂果乳油100―300倍液注入蟲孔，施藥后，用濕泥封孔。